Gereja Kristen Korea di Jepang (Jepang: 在日大韓基督教会, bahasa Korea: 재일대한기독교회) dibentuk pada 1909 oleh para misionaris Presbiterian asal Korea.[1] Pastor Han Sok-Po utamanya menginjili kalangan pelajar Korea di Tokyo. Dari 1915, umat Presbiterian Korea mengirim tambahan misionaris dan gereja di Jepang tersebut bertumbuh cepat. Kongregasi tersebut berada dalam seluruh belahan Jepang. Pada 1934, Gereja Korea di Jepang didirikan. Pada 1939, gereja tersebut dipaksa untuk menjadi bagian dari Gereja Kristus di Jepang. Setelah Perang Dunia II, gereja tersebut dipisah dan menghimpun Sidang Umum Gereja Kristen Korea di Jepang. Pengakuan Iman Rasuli dan Pengakuan Iman Westminster menjadi dokumen-dokumen utamanya. Gereja-gereja mitranya adalah Gereja Presbiterian di Kanada dan Gereja Presbiterian di Korea.[2]
Denominasi tersebut memiliki 100 kongregasi dan 7.200 anggota yang dilayani oleh 116 pastor.[3] Gereja tersebut adalah anggota dari Persekutuan Gereja-gereja Reformed se-Dunia.[4]